Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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