Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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