Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms