Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms