Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms