Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms