Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB1P82279 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB1P82279 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB1P82279 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB1P82279 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB1P82279 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB1P82279 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB1P82279 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB1P82279 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB1P82279 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB1P82279 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB1P82279 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB1P82279 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB1P82279 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB1P82279 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB1P82279 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB1P82279 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB1P82279 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB1P82279 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB1P82279 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB1P82279 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB1P82279 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB1P82279 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB1P82279 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB1P82279 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB1P82279 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB1P82279 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms