Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ACTBP60709 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ACTBP60709 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ACTBP60709 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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ACTBP60709 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ACTBP60709 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTBP60709 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ACTBP60709 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACTBP60709 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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