Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms