Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRG3P56975 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRG3P56975 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRG3P56975 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRG3P56975 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms