Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP9P55211 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP9P55211 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP9P55211 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP9P55211 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP9P55211 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP9P55211 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP9P55211 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms