Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms