Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
SMARCA4P51532 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA4P51532 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA4P51532 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA4P51532 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA4P51532 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA4P51532 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA4P51532 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms