Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms