Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF6P49848 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms