Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP153P49790 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP153P49790 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP153P49790 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP153P49790 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP153P49790 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP153P49790 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP153P49790 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP153P49790 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP153P49790 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP153P49790 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP153P49790 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP153P49790 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP153P49790 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP153P49790 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP153P49790 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP153P49790 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP153P49790 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP153P49790 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP153P49790 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP153P49790 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP153P49790 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP153P49790 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP153P49790 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP153P49790 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP153P49790 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP153P49790 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP153P49790 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP153P49790 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP153P49790 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP153P49790 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP153P49790 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP153P49790 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP153P49790 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP153P49790 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP153P49790 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP153P49790 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP153P49790 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms