Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms