Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIP4K2AP48426 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms