Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms