Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms