Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBEC1P41238 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms