Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPARGP37231 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPARGP37231 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPARGP37231 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPARGP37231 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPARGP37231 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPARGP37231 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms