Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNA7P36544 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms