Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL9P32969 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL9P32969 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms