Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms