Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms