Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSFA2P28290 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms