Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MYF6P23409 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms