Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF1P22415 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USF1P22415 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USF1P22415 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USF1P22415 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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