Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF3P18847 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF3P18847 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF3P18847 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms