Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTPS1P17812 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS1P17812 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms