Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DESP17661 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DESP17661 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DESP17661 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DESP17661 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DESP17661 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DESP17661 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DESP17661 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DESP17661 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DESP17661 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DESP17661 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DESP17661 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DESP17661 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DESP17661 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DESP17661 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DESP17661 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DESP17661 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms