Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD46P15529 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD46P15529 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms