Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms