Protein–RNA interactions for Protein: P09105

HBQ1, Hemoglobin subunit theta-1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBQ1P09105 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
HBQ1P09105 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBQ1P09105 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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