Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCP08575 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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