Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBL3O95164 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBL3O95164 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBL3O95164 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBL3O95164 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBL3O95164 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBL3O95164 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBL3O95164 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBL3O95164 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBL3O95164 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBL3O95164 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBL3O95164 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBL3O95164 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBL3O95164 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBL3O95164 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL3O95164 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL3O95164 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL3O95164 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL3O95164 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL3O95164 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL3O95164 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL3O95164 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL3O95164 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL3O95164 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL3O95164 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL3O95164 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL3O95164 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL3O95164 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL3O95164 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL3O95164 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL3O95164 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms