Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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UBXN7O94888 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN7O94888 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN7O94888 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN7O94888 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN7O94888 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN7O94888 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN7O94888 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN7O94888 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN7O94888 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN7O94888 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN7O94888 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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