Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNQ3O43525 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms