Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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