Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC7A4O43246 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms