Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNMO15061 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNMO15061 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNMO15061 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNMO15061 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNMO15061 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNMO15061 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNMO15061 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNMO15061 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNMO15061 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNMO15061 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNMO15061 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNMO15061 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNMO15061 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNMO15061 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNMO15061 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNMO15061 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNMO15061 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNMO15061 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNMO15061 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNMO15061 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNMO15061 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNMO15061 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNMO15061 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNMO15061 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms