Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3C2AO00443 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms