Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms