Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARID3CA6NKF2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3CA6NKF2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms