Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP69A5D8W1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms