Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms