Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms