Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHDC2Q9Y2U9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms