Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms